Oleksynowa K., Kozub M., Miczyński J., Rostworowski W. 1969. Some thufur-like forms in the lower mountain forest zone of the Polish Tatra mountains. Polish Journal of Soil Science, nr 1, vol. II, 73-79. (Udział 25 % – prace terenowe i laboratoryjne, rysunki, współudział w opracowywaniu wyników).
Miczyński J. 1978. Pył i SO2 w Kotlinie Sądeckiej. Wydawnictwo Naczelnej Organizacji Technicznej „Aura”, nr 67, 12-13.
Miczyński J. 1980. Zanieczyszczenie powietrza atmosferycznego Doliny Popradu i Krynicy. Zesz. Nauk. AR w Krakowie, nr 160, 273-282.
Miczyński J. 1983. Niektóre składniki chemiczne pyłu opadającego na teren Kotliny Sądeckiej. Ochrona Powietrza, Katowice nr 3 (95), 57-61.
Model równania umożliwiający prognozowanie stężenia pyłu w powietrzu atmosferycznym miasta Nowego Sącza. Zesz. Nauk. AR w Krakowie nr 187, Melioracje z. 11, 143-151.
Miczyński J. 1985. Wpływ czynników meteorologicznych na zanieczyszczenie powietrza atmosferycznego na przykładzie Limanowej. Zesz. Nauk. AR w Krakowie, nr 190, 134 -136.
Miczyński J. 1988. Oddziaływanie niektórych czynników topoklimatycznych na zanieczyszczenia powietrza atmosferycznego na przykładzie Bukowiny Tatrzańskiej. Problemy Uzdrowiskowe z. 3-4 245/246, 45-51.
Miczyński J. 1989. The degree of air pollution in the atmosphere at Stary Sącz, and its relation to selected meteorological elements. Zeszyty Problemowe Postępów Nauk Rolniczych, z. 369, 115-121.
Miczyński J. 1990. Zanieczyszczenie powietrza atmosferycznego w warunkach górskich na przykładzie województwa nowosądeckiego. 1990. Zesz. Nauk. AR w Krakowie, Rozprawa habilitacyjna nr 134, Kraków, 1-122.
Miczyński J., Zawora T. 1990. Opad pyłu i zakwaszenie środowiska na obszarze Ojcowskiego Parku Narodowego. 1990. Informator Reg. Zakł. Upowszechniania Postępu Akademii Rolniczej w Krakowie, nr 287, 77-78. (Udział 70 % - koncepcja i metodyka pracy, pomiary terenowe, opracowanie wyników, wnioski, współredakcja tekstu).
Miczyński J., Zawora T. 1990. Opad pyłu w otoczeniu zbiornika wody pitnej w Dobczycach. Zesz. Nauk. AR w Krakowie nr 246, Sesja Naukowa z. 27, 183-188. (Udział 50 % - koncepcja i metodyka pracy, pomiary terenowe, współredakcja tekstu).
Miczyński J. 1983, Melioracje powietrza atmosferycznego w kotlinach Podhala. Materiały ogólnopolskiej konferencji nt: Meteorologiczna osłona rolnictwa w skali kraju, województwa i gospodarstwa rolnego, Komitet Meteorologii i Fizyki Atmosfery PAN- AR w Szczecinie, 24-25.
Kostrubiec Z., Laskowski A. 1988. O składzie chemicznym wód Pienińskiego Parku Narodowego. Zanieczyszczenie dopływów zbiornika Rożnowskiego. Aura, 16-17. ( koncepcja pracy, kierownictwo naukowe i organizacyjne oraz współredakcja tekstu, J. Miczyński)
Chmielniak G., Drzewiecki B., Filip J., Gorajczyk S., Mazgaj D. 1988 Zanieczyszczenie dopływów zbiornika Rożnowskiego. Aura 1988, 17-18 (koncepcja pracy, kierownictwo naukowe i organizacyjne oraz współredakcja tekstu J. Miczyński).
Miczyński J., Zawora T. 1988. Kształtowanie się zapylenia powietrza atmosferycznego przy zróżnicowanej rzeźbie i pokryciu terenu (na przykładzie otoczenia zbiornika wody pitnej w Dobczycach ). XXII Ogólnopolski Zjazd Agrometeorologów.„Historia i dorobek agrometeorologii w poszczególnych regionach kraju”, Kraków, 30. (Udział 50 % – koncepcja badań, metodyka, badania terenowe, opracowanie wyników, współredakcja tekstu).
Miczyński J., Zawora T., Pasela E., Kołodziej J. 1988. Dynamika dobowych zanieczyszczeń powietrza atmosferycznego na przykładzie zlewni eksperymentalnej Ratanica. Informator Regionalny Zakładu Upowszechniania Postępu AR w Krakowie, nr 271, 91-93. (Udział 50 % w opracowaniu – koncepcja i program badań, interpretacja wyników, współredakcja tekstu).
Miczyński J., Marzec Z. 1977. Studium zanieczyszczenia powietrza atmosferycznego Doliny Popradu i terenów przyległych. Opracowanie wykonane dla Urzędu Wojewódzkiego w Nowym Sączu, AR Kraków, maszynopis, 1-64. (Udział 60 % – koncepcja i organizacja badań, obliczenia, rysunki, analiza wyników, opracowanie rozdziałów dotyczących zanieczyszczeń powietrza i ich związków z czynnikami pogody).
Pasela E., Olechnowicz-Bobrowska B., Zawora T., Miczyński J. 1977. Charakterystyka klimatyczna powiatu miechowskiego. Maszynopis, Zespół Agrometeorologii AR Kraków, 1-22. (Udział 25% w wykonaniu opracowania).
Miczyński J., Marzec Z. 1978. Studium zanieczyszczenia powietrza atmosferycznego Limanowej, Mszany i Rabki. Opracowanie wykonane dla Urzędu Wojewódzkiego w Nowym Sączu, AR Kraków, maszynopis, 1-60. (Udział 70 % opracowanie koncepcji i organizacja badań, obliczenia, rysunki, analiza wyników, redakcja tekstu).
Miczyński J., Zawora T. 1980. Studium zanieczyszczenia powietrza atmosferycznego Beskidu Niskiego. Opracowanie wykonane dla Urzędu Wojewódzkiego w Nowym Sączu, AR Kraków, maszynopis, 1-87, (Udział ok. 70 % -opracowanie, koncepcja i organizacja badań, opracowanie i analiza wyników, współredakcja tekstu).
Miczyński J., Figurny A., Wajda A. 1995. Ocena środowiska w obiektach turystycznych w otoczeniu Jeziora Solińskiego. Materiały recenzowane Międzynarodowej Konferencji Naukowej „Ekologiczne i ekonomiczne uwarunkowania rozwoju gospodarczego Karpat Południowo-Wschodnich”. Bieszczady maj 1995, 342-348. (Udział 75 % - koncepcja i organizacja badań, redakcja tekstu).
Hałuszka J., Pisiewicz K., Miczyński J., Romer W., Tomalak W. 1998. Air pollution and respiratory health in children: the PEACE panel study in Kraków, Poland. Official Journal of the European Respiratory Society Reviev 8: 52, 94-100. (Udział 20 % - współudział w koncepcji i organizacji badań, analizie wyników i redakcji tekstu).
Miczyński J., Tarnowski R., Wójcik M. 1994. Wstępna ocena zanieczyszczeń w profilu pionowym Rabka-Luboń Wielki w aspekcie prowadzonej gazyfikacji Rabki. XXV Zjazd Agrometeorologów, Olsztyn, 125-128. (Udział ok. 70 % - koncepcja i Organizacja badań, współudział w opracowywaniu wyników i redakcji tekstu).